SCIENCE - Un “au revoir” de 62 pages. Le conseil scientifique mis en place en mars 2020 aux premiers cas de Covid-19 vient de dévoiler son dernier avis ce mercredi 20 juillet sur la pandémie de coronavirus , intitulé “vivre avec les variants”. Le rapport rédigé par les 16 scientifiques a été remis au gouvernement la veille à 13 heures.

Après un avant-propos rappelant le travail effectué (300 réunions en un peu plus de deux ans), les chercheurs font le point sur la situation actuelle et sur l’avenir du virus en France.

Après avoir analysé la situation et notamment le pic de la 7e vague du variant BA.5 qui semble poindre, le Conseil scientifique se veut plutôt fataliste: au vu de son implantation mondiale, le coronavirus ne va pas disparaître et de nouvelles vagues vont avoir lieu plus ou moins régulièrement, souvent portées par de nouveaux variants.

La bonne nouvelle, c’est que les données actuelles semblent montrer que l’immunité contre les formes graves après une triple vaccination reste efficace et stable dans le temps. Sauf pour les personnes âgées et chez ceux ayant des facteurs de risque, qui auront besoin de rappels réguliers.

“Ce contexte suggère que l’impact du SARS-CoV-2 va diminuer progressivement, mais ne présage pas d’une absence de pics de circulation des virus à court terme”, note le Conseil scientifique , qui a ensuite imaginé à court terme trois scénarios pour l’automne 2022. Ainsi que trois réponses possibles, où la question du port du masque est très présente.

Du “variant X” jusqu’au retour d’Omicron

Le futur le plus incertain se trouve dans le scénario 3, dans lequel “l’émergence d’un variant X doté d’une capacité d’échappement immunitaire et d’une contagiosité suffisante pour être responsable d’une nouvelle vague épidémique” apparaîtrait.

En clair, cela voudrait dire qu’apparaîtrait un nouveau variant très différent des différents lignages d’Omicron qui ont déjà touché la France (BA.1, BA.2, BA.5). Un scénario avec une “probabilité relativement élevée” à l’avenir très incertain. “La sévérité des manifestations cliniques associées à ce nouveau variant est imprévisible, et peut aller vers une moindre ou une plus grande sévérité”, note le Conseil scientifique.

Le scénario 2, lui, est le plus optimiste. Dans celui-ci, aucun nouveau variant très différent n’émerge. Mais cela ne veut pas dire qu’il n’y aura pas de vague hivernale. En effet, une reprise épidémique est “attendue du fait de la baisse de l’immunité populationnelle avec le temps et de la plus grande transmissibilité des coronavirus en saison froide”, rappelle le Conseil scientifique.

Dans de telles conditions, “on peut espérer que le retentissement hospitalier associé à cette reprise d’un variant déjà connu sera gérable”, car notre système immunitaire sera bien entraîné.

Le risque d’un variant de seconde génération

Reste enfin le scénario 1, qui fait écho à ce que nous vivons actuellement avec le variant BA.5: “Une succession de vagues épidémiques liées à l’émergence de sous-variants d’Omicron, avec un retentissement hospitalier moins important comparé à celui des vagues liées aux VOC (variants concernants dont beta, delta, NDLR ) du début de la pandémie”.

On est ici dans un entre deux, car on parle de variants relativement proches d’Omicron, qui seraient soient des cousins de ceux déjà connus, ou bien des descendants de ceux-ci. “Le sous-variant actuellement source d’inquiétude est le BA.2.75 apparu en Inde, avec un avantage de transmissibilité par rapport au variant BA.2 déjà présent dans ce pays”, précise l’avis.

Comme nous le précisions dans notre article consacré à BA.2.75 , nous avons ici affaire à une version du coronavirus qui descend de BA.2, mais avec de très nombreuses mutations. Il est trop tôt pour dire s’il a suffisamment d’avantages pour s’imposer et provoquer une vague plus importante. Mais la bonne nouvelle, c’est que son profil étant tout de même proche d’Omicron, le risque de formes graves ne devrait pas fondamentalement changer, nous expliquait Étienne Simon-Lorière, responsable de l’unité Génomique évolutive des virus à ARN à l’Institut Pasteur.

La question du retour du masque et des restrictions

Une fois ce constat posé, l’avis va plus loin en proposant trois options pour répondre à cette très probable nouvelle vague automnale. La question qui se pose, c’est de savoir à quel moment de possibles mesures de restrictions contraignantes devront être mises en place pour limiter la circulation du coronavirus.

Les trois dernières vagues de 2022 ont atteint leur pic sans l’aide de mesures visant à diminuer la propagation du virus et sans que le système de santé soit submergé. Si le critère hospitalier reste le seul qui importe, cela voudrait dire qu’il faudra tolérer “un niveau élevé de circulation du virus lors des vagues épidémiques, dès lors que les personnes à risque de formes graves sont protégées par la primovaccination et des rappels répétés”, précise le Conseil scientifique.

Une option qui est “privilégiée, même tacitement, si des mesures obligatoires de protection, de type port du masque obligatoire dans certains lieux, ne sont pas proposées par les autorités et sont peu acceptées par la population”, notent les chercheurs.

La seconde option est celle “privilégiée par le Conseil scientifique COVID-19”. En plus de la saturation hospitalière, les auteurs proposent d’apprécier plus globalement “l’impact sanitaire (morbidité, mortalité, hôpital) ainsi que de l’impact économique (absentéisme au travail)”.

Dans cette option, des mesures de contrôle, comme “l’obligation du port du masque dans certains lieux” doit être décidée pour diminuer la taille du pic épidémique et protéger les plus fragiles, même si l’hôpital tient le choc. Les experts en profitent pour rappeler que fin juin, 71% des Français se déclaraient favorables au retour du masque dans les transports.

Assainir l’air pour lutter efficacement contre le Covid-19

La dernière option s’apparente aux stratégies de type “Zéro Covid”, avec l’idée de contrôler au maximum l’épidémie, notamment via le port du masque généralisé, le traçage des contacts et l’isolement strict des cas ainsi que des contrôles aux frontières. Mais le Conseil scientifique rappelle que les pays ayant suivi cette stratégie avec succès ont finalement dû faire face à une vague importante avec l’arrivée des variants Omicron (sauf pour le Japon).

Enfin, les chercheurs appellent surtout à préparer l’avenir. Amélioration du dépistage, amélioration des vaccins, séquençage des variants plus réactif via l’analyse des eaux usées... et, surtout, amélioration de la qualité de l’air. “Sur le plus long terme, il est important d’investir dès maintenant dans d’autres types de mesures innovantes, notamment des mesures permettant d’améliorer de façon pérenne la qualité de l’air intérieur”.

Le Conseil scientifique recommande donc au gouvernement “des investissements plus conséquents visant à améliorer la qualité de l’air intérieur par une meilleure ventilation des bâtiments”. Un combat nécessaire, mais encore peu développé .

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CORONAVIRUS - La pandémie n’est pas terminée, mais le Conseil scientifique, lui, a fait son temps. Voilà ce qu’explique l’instance dans un avis rendu le 23 juin dernier et publié ce mardi 5 juillet. Alors que la septième vague de Covid ne cesse de prendre de l’ampleur en France (son pic est attendu fin juillet), portée par les variants BA.4 et BA.5 , cette réunion d’une trentaine de spécialistes présidée par Jean-François Delfraissy et qui aura conseillé l’exécutif depuis le début de la crise sanitaire va cesser ses activités.

Mais Emmanuel Macron et le gouvernement ne vont pas pour autant se retrouver seuls à devoir anticiper les prochains mois. Car si le Conseil scientifique s’arrête, c’est parce qu’il devrait être remplacé par un nouveau “comité de veille et d’anticipation des risques sanitaires” auprès des ministres de la Santé François Braun et de la Recherche Sylvie Retailleau, comme le prévoit un projet de loi sanitaire qui arrive à partir de ce mardi en commission à l’Assemblée nationale.

Fin du conseil scientifique le 31 juillet

Ainsi, puisque ce nouveau comité est amené à “formuler des recommandations qui seront transmises aux autorités”, écrit encore le Conseil scientifique, ce dernier “mettra fin à ses activités le 31 juillet”. D’ici là, il invite toutefois les deux instances à coopérer au mieux, entre elles et avec les Autorités régionales de santé, dans un contexte de propagation de l’épidémie, et alors que les appels à l’injection d’une quatrième dose de vaccin aux personnes âgées et des seniors immunodéprimés sont martelés.

En outre, le Conseil scientifique insiste sur les leçons tirées de la crise et qui devront être mises en œuvre par la nouvelle instance. “Le Conseil scientifique insiste sur l’importance de la multidisciplinarité (il était composé de virologues, épidémiologistes, infectiologues, modélisateurs, mais aussi psychiatre, anthropologue, vétérinaire, NDLR) qui doit demeurer au sein de ce nouveau comité de veille et d’anticipation des risques sanitaires”, peut-on notamment lire dans l’avis publié ce mardi.

Un texte dans lequel le Conseil précise que les futurs avis seront transmis aux présidents de l’Assemblée nationale et du Sénat, et invite à ce qu’ils continuent à être rendus accessibles au public “dans les meilleurs délais” après transmission aux autorités. “Au regard de son expérience, le Conseil estime que la connaissance la plus large possible du contenu des avis ou recommandations en matière de veille et d’anticipation est d’intérêt général au regard des effets recherchés dans la gestion de l’épidémie auprès de l’ensemble de la population et de ses différentes composantes, publiques et privées, et pas seulement au sein des pouvoirs publics.”

Une septième vague sous surveillance

Par ailleurs, concernant l’avenir de l’épidémie, le Conseil scientifique suggère que des dispositions de veille soient maintenues jusqu’au 31 mars 2023, de manière à ce que les pouvoirs publics soient en capacité de réagir en cas de “rebond au cours de l’automne ou de l’hiver”, surtout si celui-ci était “accompagné de mutations du virus”. Il juge en outre “proportionné” le fait de pouvoir recourir au pass sanitaire à l’arrivée aux frontières de l’Hexagone, en Corse et en Outre-mer, et espère même que le dispositif serait pensé, le cas échéant, au niveau européen.

Enfin, face à cette septième vague dont l’ampleur est probablement sous-estimée du fait d’une “lassitude à la déclaration des différents acteurs”, le Conseil scientifique note que son ampleur est difficile à prévoir. Plusieurs points de vigilance sont toutefois déjà pointés: un niveau élevé “pour la saison” des hospitalisations, une situation à surveiller de près en Martinique et plus généralement aux Antilles, et enfin une mortalité importante chez les plus de 80 ans au Portugal, pays frappé avant la France par la vague en cours.

En attendant de voir l’évolution de la situation, le Conseil scientifique propose par mesure de précaution de réintroduire les gestes barrières, d’améliorer le suivi hospitalier de l’évolution de l’épidémie et donc de pousser au deuxième rappel pour les plus fragiles. Et insiste sur cet éventuel rebond au sortir de l’été, qui doit inciter à la vigilance et au maintien de capacités de réaction rapide.

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